Trong thời kỳ Chiến tranh thế giới thứ 2, người Nhật Bản xâm lăng Việt Nam khi này do Pháp bảo hộ và bắt đầu xây dựng căn cứ để chống lại Đồng Minh ở Đông Nam Á. Quân đội Nhật lưu lại tại Việt Nam cho tới khi Nhật Bản đầu hàng đồng minh vào năm 1945. Hoạt động này đã để lại nhiều cuộc phối ngẫu giữa người Việt Nam và lính Nhật; và có nhiều lính Nhật đã ở lại Việt Nam và chiến đấu trong hàng ngũ Việt Minh chống lại người Pháp.

Thời kỳ Chiến tranh Việt Nam, nhiều người Nhật đã viếng thăm miền Bắc Việt Nam và một lượng đáng kể người Nhật đã sang miền Nam Việt Nam làm việc trong các công ty xây dựng dịch vụ. Thời gian gần đây, nhiều người Nhật đã đến và ở lại Việt Nam vì nhiều lý do khác nhau. Trong số đó, lý do chính là các công việc xây dựng, sản xuất và dịch vụ tài chính. Ngoài ra còn các công việc viện trợ của chính phủ Nhật Bản (Nhật Bản đang là nước viện trợ lớn nhất cho Việt Nam). Theo Japan Foundation, Hà Nội có khoảng 5000 công dân Nhật sinh sống.[6]